故事叙述了小马Twilight Sparkle为了执行导师Celestia公主给她的任务，与助手Spike一起来到小马镇学习有关友谊魔法的知识，在学习和生活的过程中她结识了五位好朋友，并获得了真正的友谊，与朋友们共同保护小马国，并在非凡日常中体会友…

莉拉成为一名熟练的销售助理，埃莱娜则固执地继续她的学业，准备离开小镇去比萨上大学。一次度假期间，两个女孩与儿时的老相识尼诺重聚，这次邂逅将永远改变他们之间的关系，将两个女孩投射到两个完全不同的世界。

一行人在深山裡迷了路，還得應付一群軍閥頭目及外星異形，但最後卻無人倖免。一條異變毒蛇因其幼卵受人類摧殘，決定以牙還牙，將無端闖入的人類趕盡殺絕。

一只临时组成一个乐队，随着比赛他们并不相信每个人都会赢，他们面临各种障碍。很多家庭和很棒的竞争对手让他们感到沮丧。

五个月后，传奇解决了所有时间错误。但时间线外的魔法生物开始出现影响时间线，魔法顾问康斯坦丁及变形怪Charlie加入了传奇小队。另一方面，时间管理局为应对魔法生物的出现也开始建立防范机制，Nate为了逃避情伤也加入了时间管理局与A…

来自无尽森林的邪恶力量开始侵食着整个小马国，暮光闪闪与她的朋友们再一次踏上的新的一段旅程，从而化解这即将毁灭小马国的危机，并揪出那个誓言要毁灭整个小马国的神秘敌人。